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珠江所龜鱉遺傳育種創新團隊在中華鱉性別研究領域取得新進展
2024-04-08 14:30:47  來源:珠江水產研究所

近日,珠江水產研究所育種室龜鱉遺傳育種創新團隊在中華鱉性別研究領域取得系列進展,相關研究成果“Identification of Sex-Specific Markers and Candidate Genes Using WGS Sequencing Reveals a ZW-Type Sex-Determination System in the Chinese Soft-Shell Turtle (Pelodiscus sinensis)”發表于International Journal of Molecular Sciences(JCR Q1,IF2022=5.60),祝駿賢博士和汪泳昌碩士為共同第一作者,朱新平研究員和李偉副研究員為共同通訊;“Whole-Genome Identification and Characterization of the DKK Gene Family and Its Transcription Profiles: An Analysis of the Chinese Soft-Shell Turtle (Pelodiscus sinensis)”發表于Animals(JCR Q1,IF2022=3.00),汪泳昌碩士和祝駿賢博士為共同第一作者,李偉副研究員和新疆農業大學張俊杰副教授為共同通訊。

上述研究得到了國家自然科學基金(32102792)、廣東省農業農村廳種業振興項目(2022-SJS-00-00;2022-SPY-00-015)和中國-東盟海洋合作基金(CAMC-2018F)等項目的資助。

研究開發了一套準確、高效的工作流程,用于篩選具有ZW或XY性別決定系統物種的性別特異性序列。基于該流程,對中華鱉雌性和雄性參考基因組進行了從頭組裝,經過兩輪的比對和篩選,最終獲得了4.01 Mb的雌性特異性序列,并開發了7對性別特異性引物,且在初步驗證、群體驗證和胚胎驗證中準確率均為100%。通過對中華鱉雌性特異性序列的NR注釋,發現了42個性別決定候選基因,其中包括RanEif4etCrkl等。功能注釋的結果顯示,8個KEGG通路被顯著富集,其中胰島素信號通路和cAMP信號通路與性別決定相關。研究為中華鱉性控育種和性別決定機制的研究提供了有利的分子工具和潛在的分子靶標。此外,研究還通過比較基因組研究,鑒定了中華鱉DKK基因家族成員,并通過系統發育、基因共線性、基因結構、蛋白結構域、保守motif、啟動子保守位點、信號肽、轉錄因子、性腺轉錄譜和組織表達譜的系統分析,初步揭示了DKK基因家族成員在中華鱉性別發育中的潛在功能。




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