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珠江所對魚類DNA 條形碼數據庫的開發取得進展
2024-06-05 16:56:47  來源:珠江水產研究所

近日,珠江水產研究所觀賞漁業研究室在國際學術期刊《Database》(JCR 1區,IF2022=5.8)在線發表“CoSFISH: a comprehensive reference database of COI and 18S rRNA barcodes for fish”的研究論文。該研究得到了中國-東盟海洋合作基金(CAMC-2018F)、2022年省級鄉村振興戰略專項種業振興行動(2022SBH00001)和國家淡水水產種質資源庫(FGRC18537)等項目資助。珠江所為論文第一單位,王媛媛博士為第一作者,牟希東研究員為通訊作者。

魚類種類繁多,準確的物種鑒定是不可或缺的基礎,構建一個詳盡的魚類參考數據庫是必要的。在國家淡水水產種質資源庫珠江分庫和廣東省淡水水產種質資源庫基因庫的基礎上,結合從FishBase網站收集基本的魚類物種信息,建立了一個包含線粒體基因COI和核基因18S rRNA條形碼的魚類綜合參考數據庫——CoSFISH。CoSFISH包含了21535條COI條形碼和1074條18S rRNA條形碼,涵蓋了21589種魚類,分別隸屬于8個綱和90個目。這一數據庫的建成為魚類多樣性、系統發育學和生物進化研究提供了數據支撐。

全文鏈接:https://doi.org/10.1093/database/baae038

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