日本水產廳于12月7日會見記者，就上個月在大西洋金槍魚類保護國際委員會（ICCAT）上指出的中國臺灣漁船具有更換金槍魚漁獲地作業的問題進行了說明。
日本水產廳指出，臺灣將在大西洋捕獲的大眼金槍魚作假數字統計，并更換漁獲地為印度洋，因而日本指出臺灣在大西洋捕獲的金槍魚數量已經大幅度地超過了臺灣金槍魚的漁獲配額1.65萬噸。
一般情況下，印度洋延繩漁業捕撈的大眼金槍魚總量和黃鰭金槍魚總量的比例大致相同，或者大眼金槍魚略微少一些。然而臺灣漁船的金槍魚漁獲量比例卻與此相反，所以調查人員對其冷凍運輸船進行了調查，結果發現臺灣漁船具有更換漁獲地的問題。
日本水產廳指出即使按照大眼金槍魚占七成，黃鰭金槍魚占三成的漁獲比例計算，臺灣也有1.9萬噸漁獲物進行了漁獲地更換。而這個數據是最低估計數，實際數據可能會大很多。
臺灣方面雖然承認了更換的事實，但是以“更換量至多為0.4萬噸，并且不是有組織的操作”為由，作出了否定答復。另外，中國也發現有更換漁獲地的現象，推測可能有0.1萬噸（漁獲配額為0.5萬噸）的金槍魚漁獲物進行了漁獲地址更換。
針對這一系列問題，山下潤遠洋科長表示：日本除了今后繼續嚴格檢查運輸船之外，還希望進行DNA鑒定等，徹底禁止漁獲地的更換。同時他還擺出了對臺灣漁船的不正當行為對抗到底的姿態。
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